Terlepas dari kelebihan di atas, ada beberapa kekurangan sekolah di Amerika, antara lain:
Total Biaya mahal
Biaya sekolah pilot di sini sebenarnya tidak jauh berbeda dari di Indonesia atau Filipina, hanya saja biaya lain-lain seperti: belum termasuk biaya akomodasi, dan tiket pesawat ke Amerika cukup mahal.
Harus endorsement
Endorsement adalah ujian kesetaraan dimana pilot yang lulus dari sekolah luar negeri (bukan cuma dari Amerika) akan diuji kemampuan nya apakah sesuai dengan standar yang berlaku di Indonesia sebelum boleh melamar kerja di Indonesia.
Proses endorsement ini memakan waktu 2- 4 bulan (tergantung biaya dan cuaca).
Jauh dari rumah
Bagi sebagian orang tua, ini bisa jadi pertimbangan tersendiri. Sebagai gambaran, naik pesawat dari Jakarta ke Florida (salah satu state di Amerika) memakan waktu 20++ jam, itu pun harus transit dulu.
Namun perlu di ingat jika seorang siswa ingin menjadi pilot, siswa tersebut harus siap jauh dari rumah karena nanti saat sudah bertugas, mereka akan sering berpergian.